精确分割器官 - 危险(OARS)是优化放射治疗计划的先驱。现有的基于深度学习的多尺度融合体系结构已显示出2D医疗图像分割的巨大能力。他们成功的关键是汇总全球环境并保持高分辨率表示。但是,当转化为3D分割问题时,由于其大量的计算开销和大量数据饮食,现有的多尺度融合体系结构可能表现不佳。为了解决此问题,我们提出了一个新的OAR分割框架,称为Oarfocalfusenet,该框架融合了多尺度功能,并采用焦点调制来捕获多个尺度的全局本地上下文。每个分辨率流都具有来自不同分辨率量表的特征,并且多尺度信息汇总到模型多样化的上下文范围。结果,功能表示将进一步增强。在我们的实验设置中与OAR分割以及多器官分割的全面比较表明,我们提出的Oarfocalfusenet在公开可用的OpenKBP数据集和Synapse Multi-Organ细分方面的最新最新方法优于最新的最新方法。在标准评估指标方面,提出的两种方法(3D-MSF和Oarfocalfusenet)均表现出色。我们的最佳性能方法(Oarfocalfusenet)在OpenKBP数据集上获得的骰子系数为0.7995,Hausdorff的距离为5.1435,而Synapse Multi-Organ分段数据集则获得了0.8137的骰子系数。
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变压器体系结构在许多最新应用程序中取得了显着进展。然而,尽管他们取得了成功,但现代变形金刚依赖于自我发挥的机制,其时间和空间复杂性在输入的长度上是二次的。已经提出了几种方法来加快自我注意力的机制以实现次级运行时间。但是,这些作品中的绝大多数并不伴随着严格的错误保证。在这项工作中,我们在许多情况下就自我注意的计算复杂性建立了下限。我们证明,自我注意力的时间复杂性在输入长度上必定是二次的,除非强烈的指数时间假设(SETH)是错误的。即使注意力计算仅执行大约和各种注意力机制,该论点也存在。作为对我们的下限的补充,我们表明确实可以使用有限的泰勒级数在线性时间中近似点产物自我发作,而成本依赖于多项式顺序。
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动机:针对感兴趣的蛋白质的新颖化合物的发展是制药行业中最重要的任务之一。深层生成模型已应用于靶向分子设计,并显示出令人鼓舞的结果。最近,靶标特异性分子的产生被视为蛋白质语言与化学语言之间的翻译。但是,这种模型受相互作用蛋白质配对的可用性的限制。另一方面,可以使用大量未标记的蛋白质序列和化学化合物,并已用于训练学习有用表示的语言模型。在这项研究中,我们提出了利用预审核的生化语言模型以初始化(即温暖的开始)目标分子产生模型。我们研究了两种温暖的开始策略:(i)一种一阶段策略,其中初始化模型是针对靶向分子生成(ii)的两阶段策略进行培训的,该策略包含对分子生成的预处理,然后进行目标特定训练。我们还比较了两种生成化合物的解码策略:光束搜索和采样。结果:结果表明,温暖启动的模型的性能优于从头开始训练的基线模型。相对于基准广泛使用的指标,这两种拟议的温暖启动策略相互取得了相似的结果。然而,对许多新蛋白质生成的化合物进行对接评估表明,单阶段策略比两阶段策略更好地概括了。此外,我们观察到,在对接评估和基准指标中,梁搜索的表现优于采样,用于评估复合质量。可用性和实施​​:源代码可在https://github.com/boun-tabi/biochemical-lms-for-drug-design和材料中获得,并在Zenodo归档,网址为https://doi.org/10.5281/zenodo .6832145
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随着现代世界中对高度安全和可靠的轻质系统的需求增加,物理上无统治的功能(PUF)继续承诺可轻巧的高成本加密技术和安全钥匙存储。虽然PUF承诺的安全功能对安全系统设计师具有很高的吸引力,但已证明它们容易受到各种复杂攻击的攻击 - 最著名的是基于机器的建模攻击(ML -MA),这些攻击(ML -MA)试图以数字方式克隆PUF行为因此破坏了他们的安全。最新的ML-MA甚至还利用了PUF误差校正所需的公开辅助数据,以预测PUF响应而无需了解响应数据。为此,与传统的PUF储存技术和比较的PUF技术相反,研究开始研究PUF设备的身份验证,并进行了著名的挑战 - 响应对(CRP)的比较。在本文中,我们基于新颖的“ PUF - 表型”概念提出了一个使用ML的分类系统,以准确识别起点并确定得出的噪声记忆(DRAM)PUF响应的有效性作为助手数据依赖数据的Denoisis技术的替代方法。据我们所知,我们是第一个每个模型对多个设备进行分类的人,以实现基于组的PUF身份验证方案。我们使用修改后的深卷积神经网络(CNN)最多达到98 \%的分类精度,并与几个完善的分类器结合使用特征提取。我们还在实验中验证了在Raspberry Pi设备上模型的性能,以确定在资源约束环境中部署我们所提出的模型的适用性。
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由于缺乏可用的数据集,模型和标准评估指标,因此以多模式数据为条件的现实,生动和类似人类的合成对话手势仍然是一个未解决的问题。为了解决这个问题,我们构建了人体表达式 - aauio-Text数据集,Beat,它具有76小时,高质量的,高质量的多模式数据,这些数据从30位扬声器中捕获了八种不同的情绪,用四种不同的语言,ii)32数以百万计的框架级别的情感和语义相关注释。我们对BEAT的统计分析表明,除了与音频,文本和说话者身份的已知相关性外,对话式手势与面部表情,情感和语义的相关性。基于此观察结果,我们提出了一个基线模型,即级联运动网络(CAMN),该模型由以上六种模式组成,该模式在级联的架构中建模以进行手势合成。为了评估语义相关性,我们引入了指标,语义相关性召回(SRGR)。定性和定量实验证明了指标的有效性,地面真相数据质量以及基线的最先进性能。据我们所知,BEAT是用于研究人类手势的最大运动捕获数据集,这可能有助于许多不同的研究领域,包括可控的手势合成,跨模式分析和情感手势识别。数据,代码和模型可在https://pantomatrix.github.io/beat/上获得。
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心肌活力的评估对于患有心肌梗塞的患者的诊断和治疗管理是必不可少的,并且心肌病理学的分类是本评估的关键。这项工作定义了医学图像分析的新任务,即进行心肌病理分割(MYOPS)结合三个序列的心脏磁共振(CMR)图像,该图像首次与Mycai 2020一起在Myops挑战中提出的。挑战提供了45个配对和预对准的CMR图像,允许算法将互补信息与三个CMR序列组合到病理分割。在本文中,我们提供了挑战的详细信息,从十五个参与者的作品调查,并根据五个方面解释他们的方法,即预处理,数据增强,学习策略,模型架构和后处理。此外,我们对不同因素的结果分析了结果,以检查关键障碍和探索解决方案的潜力,以及为未来的研究提供基准。我们得出结论,虽然报告了有前途的结果,但研究仍处于早期阶段,在成功应用于诊所之前需要更深入的探索。请注意,MyOPS数据和评估工具继续通过其主页(www.sdspeople.fudan.edu.cn/zhuangxiahai/0/myops20 /)注册注册。
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生物重建VII轨道3挑战重点是在Twitter用户时间表中识别药物名称。对于我们提交这一挑战,我们通过使用多种数据增强技术扩展了可用的培训数据。然后,增强数据用于微调在一般域推特内容上预先培训的语言模型的集合。拟议的方法优于先前的最先进的算法Kusuri,并在竞争中排名高,为我们所选择的客观函数重叠F1分数。
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中枢神经系统(CNS)利用预期(APA)和补偿性(CPA)的姿势调整以保持平衡。姿势调整包括质量中心的稳定性(COM)(COM)和身体的压力分布相互影响,如果存在他们俩缺乏表现。任何可预测的或突然的扰动都可能为COM与平衡和身体的均匀压力分布的分歧铺平道路。由于其不良的APA和CPA,并引起了它们的跌倒。神经系统患者跌倒风险的最小化方法正在利用基于扰动的康复,因为它有效地恢复了平衡障碍。根据发现的结果,我们的发现,我们的发现,我们的发现,我们的发现,我们的发现,我们的发现是有效的。介绍新型3 DOF平行操纵器的设计,实现和实验评估,以治疗M. M.的平衡障碍,机器人平台允许角运动脚踝基于其拟人化的自由。赋予上下平台的最终效应分别旨在评估每只脚的压力分布和身体的com。在机器人平台的高级控制中,用于调节任务的难度水平。在这项研究中,在模拟环境中得出并验证了机器人的运动学和动态分析。还通过PID控制器成功实现了对原型的低级控制。每个平台的容量都通过一组实验来评估,考虑评估最终效应器上的脚注和类似对象的压力分布和COM。实验结果表明,这样的系统井井有条,需要通过APA和CPA进行平衡技能培训和评估。
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动机:准确识别高亲和蛋白化学对的计算模型可以加速药物发现管道。在可用的蛋白质 - 化学相互作用数据集上培训的这些模型可用于预测输入蛋白化学对的结合亲和力。然而,训练数据集可以包含称为DataSet偏差的表面图案,这导致模型记住特定于数据集的生物分子属性,而不是学习绑定机制。结果,模型的预测性能下降了看不见的生物分子。这里,我们提出了一种新的药物 - 目标亲和力(DTA)预测模型训练框架,其解决数据集偏差以改善新的生物分子的亲和预测。 DebiasedDTA使用集合学习和采样权重适应来识别和避免偏置,并且适用于大多数DTA预测模型。结果:结果表明,DebiasedDTA可以在预测看不见的生物分子之间的相互作用时提高模型。此外,可见的生物分子的预测性能也提高了。实验还表明,DebiasedDTA可以增强不同输入和模型结构的DTA预测模型,并且能够避免不同来源的偏差。预测的调查揭示了模型脱位可以减少误导性功能的重要性,并且可以使模型能够从蛋白质中学到更多。 DebiasedDTA已发布为开​​源Python软件包,以启用只有两行代码的脱叠自定义DTA预测模型。
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背景:虽然卷积神经网络(CNN)实现了检测基于磁共振成像(MRI)扫描的阿尔茨海默病(AD)痴呆的高诊断准确性,但它们尚未应用于临床常规。这是一个重要原因是缺乏模型可理解性。最近开发的用于导出CNN相关性图的可视化方法可能有助于填补这种差距。我们调查了具有更高准确性的模型还依赖于先前知识预定义的判别脑区域。方法:我们培训了CNN,用于检测痴呆症和Amnestic认知障碍(MCI)患者的N = 663 T1加权MRI扫描的AD,并通过交叉验证和三个独立样本验证模型的准确性= 1655例。我们评估了相关评分和海马体积的关联,以验证这种方法的临床效用。为了提高模型可理解性,我们实现了3D CNN相关性图的交互式可视化。结果:跨三个独立数据集,组分离表现出广告痴呆症与控制的高精度(AUC $ \ GEQUQ $ 0.92)和MCI与控制的中等精度(AUC $ \约0.75美元)。相关性图表明海马萎缩被认为是广告检测的最具信息性因素,其其他皮质和皮质区域中的萎缩额外贡献。海马内的相关评分与海马体积高度相关(Pearson的r $ \大约$ -0.86,p <0.001)。结论:相关性地图突出了我们假设先验的地区的萎缩。这加强了CNN模型的可理解性,这些模型基于扫描和诊断标签以纯粹的数据驱动方式培训。
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